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Italy: Tenders/U.O.C. PROVVEDITORATO - Ospedali Riuniti Villa Sofia Cervello/FORNITURA DI KIT ARRICCHIMENTO ESOMA/ESOMA CLINICO DA UTILIZZARE PER LANALISI DI SEQUENZIAMENTO NGS E CON LO STRUMENTO NEXTSEQ 550 DX OCCORRENTE ALLA U.O.C. DI GENETICA MEDICA DELLAZIENDA OSPEDALIERA OSPEDALI RIUNITI VILLA SOFIA CERVELLO SUDDIVISA IN NR.2 LOTTI

  1. Competition notice published

    Apr 2, 2025 7:16 AMApril 2, 2025 7:16 AM

  2. Tender submission deadline

    May 26, 2025 10:00 AMMay 26, 2025 10:00 AM

  3. Opening date

    May 27, 2025 7:00 AMMay 27, 2025 7:00 AM

  4. Contract start date

    Jul 1, 2025 12:00 AMJuly 1, 2025 12:00 AM

  5. Tender validity period

    Nov 22, 2025 11:00 AMNovember 22, 2025 11:00 AM

  6. Contract end date

    Jul 1, 2028 12:00 AMJuly 1, 2028 12:00 AM

Brief

FORNITURA DI KIT ARRICCHIMENTO ESOMA/ESOMA CLINICO DA UTILIZZARE PER LANALISI DI SEQUENZIAMENTO NGS E CON LO STRUMENTO NEXTSEQ 550 DX OCCORRENTE ALLA U.O.C. DI GENETICA MEDICA DELLAZIENDA OSPEDALIERA OSPEDALI RIUNITI VILLA SOFIA CERVELLO SUDDIVISA IN NR.2 LOTTI

Expired

The competition has expired without a winner being announced.

Deadline
May 26, 2025Expired
Award
Gestione operativa della fornitura 4% and 15 more
Procedure
OpenSingle stage
Agreement
Buying goods
Estimated value
€1.8Muntil Jul 2028

Brief

FORNITURA DI KIT ARRICCHIMENTO ESOMA/ESOMA CLINICO DA UTILIZZARE PER LANALISI DI SEQUENZIAMENTO NGS E CON LO STRUMENTO NEXTSEQ 550 DX OCCORRENTE ALLA U.O.C. DI GENETICA MEDICA DELLAZIENDA OSPEDALIERA OSPEDALI RIUNITI VILLA SOFIA CERVELLO SUDDIVISA IN NR.2 LOTTI

Laboratorie- og analyseutstyr

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  • Description

    L' Impresa che avrà offerto il prezzo totale della fornitura più basso verranno assegnati 30 punti; alle altre offerte verranno assegnati punteggi decrescenti in base alla differenza calcolata sul prezzo totale più basso secondo la seguente formula: X = P min x p P

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  • Description

    Gestione operativa della fornitura

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  • Description

    Copertura ottimale dell'intero esoma, inclusi i geni malattia, in accordo allerelease più aggiornate dei database RefSeq, GENCODE, CCDS

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  • Description

    Copertura aumentata sui geni malattia e/o su varianti patogeniche/probabilmente patogeniche (anche in regioni non codificanti) descritte in ClinVar (e/o HGMD professional ove disponibile) e in letteratura anche ottenuta con sonde aggiuntive dedicate incluse nel kit oggetto della proposta

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  • Description

    Copertura del genoma mitocondriale (chrM, ca. 17 kb) nel disegno o del kit proposto o attraverso l'integrazione con un pannello dedicato "spike-in" (che va incluso nella proposta)

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  • Description

    Flessibilità nel quantitativo minimo del DNA campione richiesto per la preparativa (fino a < o = a 50 ng)

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  • Description

    Compatibilità con DNA proveniente da sangue, tessuti, colture cellulari

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  • Description

    Ridotti tempi di preparazione della libreria da parte dell'operatore (hands-on time, escluse incubazioni) in caso di esecuzione con metodica cpmpletamente manuale

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  • Description

    Ridotti tempi di ibridazione-cattura/possibilità di attivazione di un protocollo ibridazione rapido (inferiore alle 8h)

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  • Description

    Preparativa automatizzabile con sistemi liquid-handling: l'azienda che fornisce i kit fornirà adeguato supporto per la messa a punto del protocollo su eventuali sistemi liquid-handler di aziende terze eventualmente disponibili al laboratorio, anche in tempi successivi all'inizio della fornitura

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  • Description

    Possibilità di identificare varianti puntiformi (SNVs)/indel e CNV (Copy Number Variants) su DNA genomico

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  • Description

    Compatibilità della metodica con la strumentazione standard di laboratorio (centrifuga da banco, bagno termostatato, thermal cycler), eventuale strumentazione accessoria dedicata (es. frammentatori meccanici, fornetti ibridazione, accessori specifici per centrifughe etc.) necessaria per l'esecuzione della metodica manualedovrà essere inclusa nella fornitura

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  • Description

    Elevata uniformità di coverage

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  • Description

    Copertura delle regioni target esoniche > o = 99% a 20x e > o = 96% a 50x Ottimo a 20x > o = 98% e a 50x > o = 96%

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  • Description

    Copertura ottimale delle regioni codificanti di geni associati a patologie mendeliane, la dimensione del target dovrà comunque essere compatibile con il multiplexing richiesto sulla strumentazione attualmente disponibile al laboratorio (min. 32 campioni per corsa con coverage medio 120x, su NextSeq550)

    Source

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  • Description

    Possibilità di aggiungere al target proposto regioni di interesse del laboratorio non presenti nel disegno originale, incluse sonde per regioni non-codificanti associate a patologia

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  • Description

    Organizzazione della fornitura e ricezione ordini

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  • Contact

    appaltieforniture@mailpec.ospedaliriunitipalermo.it
  • Type
    Competition
  • Location
    Palermo
  • Main code
    Laboratory reagents
    33696500

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