1105601 UiO Livsvitenskap brukerutstyr. K930.29.01 Sekvensator

Statsbygg bygger det nye Livsvitenskapsbygget (LVB) for Universitetet i Oslo og Oslo universitetssykehus på oppdrag fra Kunnskapsdepartementet og Helse Sør-Øst som medoppdragsgiver. Bygget skal være arbeidsplass for om lag 1.600 ansatte og 1.600 studenter. Oppstart for grave- og grunnarbeidene var 2. kvartal 2019 og planlagt ferdigstillelse er ultimo 2026. Her skal ulike fagmiljøer jobbe tverrfaglig for å utvikle nye løsninger på store utfordringer innen helse og bærekraft med tilgang til det beste og mest moderne utstyret som kreves for å drive forskning, undervisning og innovasjon i verdensklasse.FOA § 13-4 bokstav b. nr 2: anskaffelsen gjelder ytelser bare en bestemt leverandør kan levere, av tekniske årsaker, samt § 13-4 bokstav b. nr 3.Det skal anskaffes et kompakt og fleksibelt sekvenseringsinstrument for bruk ved Avdeling for medisinsk genetikk ved Universitetet i Oslo, tilknyttet NorSeq – den nasjonale forskningsinfrastrukturen for sekvensering. Instrumentet skal benyttes til kvalitetskontroll (QC) av sekvenseringsbibliotek, småskala genomsekvensering og verifikasjonssekvensering, samt inngå i tjenestetilbudet til forskere med behov for lave til moderate datamengder.Instrumentet skal kunne sekvensere et bredt spekter av arter og anvendelser, samt fungere som et QC‑verktøy for genom‑skala sekvenseringsinstrumenter.For å oppfylle dette formålet er det stilt følgende nødvendige minimumskrav til instrumentet:Støtte for et bredt spekter av genomiske applikasjoner, herunder 2×500 bp paired-end sekvensering med høy datakvalitetSekvenseringskapasitet opptil 30 Gb per kjøring, med fleksibel tilpasning av datamengdeSekvenseringstid på maksimalt 24 timer for 2×300 bp oppsettFleksibilitet i syklustall (minimum 100, 300, 600 og 1000 sykluser)Bruk av ferdigproduserte reagenskassetter og reagenser som kan håndteres og lagres ved romtemperaturStøtte for «index-first» sekvensering og rask generering av index reads for kvalitetskontroll og optimalisering av prøvepoolingFull kompatibilitet med Illumina-biblioteker, slik at instrumentet kan benyttes som QC-plattform for eksisterende storskala sekvenseringssystemerLeveranse av sekvensdata med minimum Q30-kvalitet ved relevante readlengder.Kravene er fastsatt på bakgrunn av oppdragsgivers faktiske behov for effektiv drift, høy datakvalitet, rask gjennomføring og sømløs integrasjon med eksisterende infrastruktur og arbeidsflyt.Vurdering av markedet og alternative løsningerOppdragsgiver har gjennomført en markedsundersøkelse (RFI) via Mercell/Doffin. Kun én leverandør meldte interesse og dokumenterte oppfyllelse av samtlige minimumskrav.Oppdragsgiver har videre, basert på fagmiljøets kjennskap til markedet, vurdert alternative teknologier og leverandører. Disse alternativene oppfyller imidlertid ikke behovet, blant annet fordi de:ikke støtter 2×300 bp paired-end sekvensering med tilsvarende kvalitethar vesentlig lengre sekvenseringstid enn 24 timer for tilsvarende oppsettikke er kompatible med Illumina-biblioteker og derfor ikke kan benyttes til kvalitetskontroll av eksisterende systemerikke tilbyr nødvendig fleksibilitet i datakapasitet opptil 30 Gb per kjøringikke støtter «index-first» sekvensering eller rask generering av index readsBruk av slike alternative løsninger vil medføre betydelige ulemper, herunder redusert datakvalitet, ineffektiv ressursutnyttelse, økt tidsbruk og manglende integrasjon med eksisterende infrastruktur. Dette anses som uforholdsmessig sett opp mot anskaffelsens formål.Konklusjon:På bakgrunn av de fastsatte kravene, og gjennomført markedsundersøkelse, foreligger det etter oppdragsgivers vurdering ingen reelle eller rimelige alternativer i markedet enn MiSeq i100 Plus fra Illumina. Dette er så langt oppdragsgiver kjenner til den eneste løsningen som oppfyller samtlige krav til funksjonalitet, ytelse og kompatibilitet. Vilkårene i FOA § 13-4 bokstav b nr. 2 og anses dermed som oppfylt.Ved eventuelle spørsmål, ta kontakt med Alf Årdal på e-post: Alf.Petter.Aardal@statsbygg.noFrist for innsigelser er 10 dager fra kunngjøringstidspunktet.